Ich nutze ebenfalls Obsidian und kann es sehr empfehlen! Jedoch muss ich dich in einer Sache korrigieren: Der Quellcode von Obsidian ist leider nicht frei verfügbar :( Dies ist wohl der größte Kritikpunkte an Obsidian. Lediglich die zahlreichen, von der Community erstellten Plugins, sind Open Source. Falls dies ein K.O.-Kriterium ist, gibt es mit Logseq eine vergleichbare Open Source-Alternative.

Zum Thema Synchronisieren: Ich habe anfangs dafür meine Nextcloud genutzt, bin damit jedoch nicht zufrieden gewesen (zu viel Synchronisation im Hintergrund, ab und zu Konflikte, etc.). Meine Vault (Ordner mit den Notizen) wird nun von Git verwaltet und es werden im Hintergrund automatisch regelmäßig Commits, Pushes und Pulls durchgeführt. Obsidian hat dazu ein Plugin namens “Obsidian Git” und auf meinem Android-Smartphone nutze ich ein Termux mit Tasker. Funktioniert nun einwandfrei. E2E ist übrigens auch mit Git möglich, siehe diesen Artikel. Jedoch nutze ich aktuell kein E2E. Zeitnah habe ich stattdessen vor das Repo auf eine vertrauenswürdige, selbstgehostete Gitea-Instanz umzuziehen.